В соответствии с пунктом 17.1 статьи 217 НК РФ доходы, получаемые физическими лицами, являющимися налоговыми резидентами РФ, за соответствующий налоговый период от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика три года и более, а также при продаже иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика три года и более, освобождаются от налогообложения.

При продаже налогоплательщиком доли в уставном капитале организации положения пункта 17.1 статьи 217 Кодекса не применяются, поскольку доля в уставном капитале является имущественным правом.

Вместе с этим, абзацем вторым подпункта 1 пункта 1 статьи 220 Кодекса установлено, что при продаже доли (ее части) в уставном капитале организации налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с получением этих доходов.

Такие разъяснения приводит Минфин РФ в письме № 03-04-05/2-461 от 16.08.2010.